C'est dans ces conditions que, l'existence d'une Fédération régionale du patronat n'étant plus requise par l'organisation des Pouvoirs Publics, l'UNIAEF s'effaça au profit de ses Comités locaux qui s'érigèrent, plus ou moins rapidement, dans chacun des ex-Territoires, en organisations patronales à caractère national.
Au Gabon, cette mutation s'accompagne d'une refonte complète par l'adoption de nouveaux statuts et d'une structure appropriée à celle du Patronat. L'Union Interprofessionnelle du GABON (UNIGABON) vit le jour le 4 septembre 1959. Sa caractéristique était de grouper indifféremment des Syndicats professionnels et des entreprises affiliées à titre individuel (ou direct), répartis entre six secteurs d'activité, résultant du dédoublement des trois grands secteurs de base, primaire, secondaire et tertiaire.
Chacun de ces secteurs était représenté par deux personnes au sein d'un Bureau qui désignait un Président, trois vice-présidents et un trésorier général.
Avant le mois de septembre 1959, il existait huit organisations professionnelles :
 le Syndicat Forestier du Gabon, constitué en octobre 1942, ayant son siège à Port-Gentil ;en décembre 1947, un groupement indépendant de ce syndicat fut créé, le Syndicat des Producteurs Forestiers de l'Estuaire du Gabon, avec deux sections, l'une à Libreville, l'autre à Paris ; en octobre 1952, ces deux organismes fusionnaient sous l'appellation de Syndicat des Exploitants Forestiers du Gabon, qui, en juin 1956, reprenait la d énomination de Syndicat Forestier du Gabon;
le Syndicat des Entrepreneurs de Travaux Publics et de Bâtiment, ainsi que des professions connexes, du Gabon, fondé en octobre 1952 ;
le Syndicat Professionnel des Usines, Sciage et de Placage du Gabon, créé en décembre 1943;
le Syndicat des Pharmacies du Gabon, constitué en avril 1956 ;
le Syndicat des Transporteurs du Gabon, instauré en septembre 1954 ;
le Syndicat des Transporteurs Africains de Libreville, né également en septembre 1954 ;
le Syndicat des Commerçants Africains de Lambaréné, fondé en mars 1955 ;
la Fédération des petites et moyennes entreprises de l'AEF, section de Libreville, instituée en décembre 1957.
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